Den dristige oppdageren Dr. Lily Houghton reiser fra London til jungelen i Amazonas. Hun er fast bestemt på å finne et gammelt tre med helbredende evner som kan endre den medisinske vitenskapen for alltid. Lily hyrer skipperen Frank Wolff og båten hans La Quila til å føre henne opp Amazonaselven. I den frodige regnskogen skjuler det seg mange farer og overnaturlige krefter, og snart står ikke bare deres egen skjebne på spill, men også hele menneskehetens.