For 1000 år siden ble den mørke krystallen skadet - kilden til balanse i universet - og verden ble delt i to raser. De onde Skeksis og de fredelige Mystics. De tre solene krysses snart, og krystallen må repareres. Ellers kommer mørket til å herske for alltid. Nå er det opp til Jen - den siste i sin rase - å gjeninnføre den biten som mangler i krystallen og ødelegge Skeksis onde imperium.